第一章　導論
　第一節　晚明的社會變遷
　　一、社會風氣的變化
　　二、學術思想的變化
　第二節 黃宗羲的學思進程
　　一、人生歷程的分期
　　二、相關文獻的考證
　
第二章　本體與工夫
　第一節　氣與理
　　一、流行與主宰
　　二、主宰的別名
　　三、流行的變化
　第二節　性與心
　　一、性善與性惡
　　二、人心與道心
　　三、以心而著性
　　四、理氣與心物
　第三節　工夫論
　　一、起點的前理解
　　二、顯現自我主宰
　　三、回復完整本體
　第四節　即工夫即本體
　　一、盈天地者何
　　二、本體的充實
　　三、工夫的多樣
　
第三章　學脈與史慧
　第一節　回護與贊許
　　一、周敦頤
　　二、程顥與程頤
　　三、程門弟子
　　四、陸九淵
　　五、陳獻章
　　六、王陽明
　　七、江右王門
　第二節　簡別與批判
　　一、心外別尋主宰為理
　　二、單就心之主宰為理
　　三、單就心之流行為理
　　附論：東林三君子
　第三節　繼承與發展
　　一、對於蕺山學的認識
　　二、對於蕺山學的發展
　第四節　經史與經世
　　一、儒者之學，經緯天地
　　二、言性命者，必究於史
　　三、功力所至，即其本體
　　四、道由器見，續傳絕學
　
第四章　分辨與定位
　第一節　黃宗羲與呂留良
　　一、呂留良的學術宗旨
　　二、黃、呂哲學架構比較
　　三、黃、呂政治思想比較
　第二節　黃宗羲與潘平格
　　一、潘平格的學術宗旨
　　二、黃宗羲對潘平格的批評
　　三、黃、潘哲學架構比較
　第三節　黃宗羲與陳乾初
　　一、陳乾初的學術宗旨
　　二、黃宗羲對陳乾初的評價
　　三、黃、陳哲學架構比較
　
第五章 佛老與天主
　第一節　黃宗羲與佛教
　　一、闢佛之史實
　　二、性理與氣心
　　三、儒學與佛學
　第二節　黃宗羲與道教
　　一、老學之界定
　　二、儒道之辨別
　　三、易學之核衡
　第三節　黃宗羲與耶教
　　一、上帝之意涵
　　二、耶穌與人鬼
　　三、天堂與地獄
　
第六章　政道與治道
　第一節　王霸之分與人性之辨
　　一、王道與霸道
　　二、為己與為人
　第二節　成人成物的治道佈局
　　一、君民之關係
　　二、權益之關係
　第三節　明夷待訪的歷史意義
　
餘論　黃宗羲與啟蒙
　
附錄一　論許孚遠儒學思想之歸屬
附錄二　《明儒學案．師說》「鄧先生」考述
附錄三　論《明儒學案序》原本與改本的學理關係
附錄四　黃宗羲的氣節問題
　
參考文獻